提交申請：將準備齊全的申請材料提交至當地農業農村行政主管部門，部分地區也可通過線上政務服務平臺進行提交。
受理：行政主管部門對申請材料進行核對、登記，檢查材料是否齊全、符合法定形式。符合標準的，予以受理，向申請人出具《受理通知書》；不符合標準但申請材料存在可以當場更正錯誤的，允許申請人當場更正；不能當場更正的，向申請人出具《補正材料通知書》。
審查：受理后，主管部門會對申報單位和材料進行詳細審查，可能包括現場核查，檢查經營場所、設備、人員等是否符合要求，以及對申請材料的真實性、合法性進行核實。
決定：主管部門根據審查結果作出是否準予許可的決定。對于符合規定的，準予許可，頒發獸藥經營許可證；對于不符合規定的，不予許可，并書面說明理由。
